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基因检测之癌症早筛 [复制链接]

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撰文

#癌症#

大多数癌症被发现时通常是晚期,此时治疗通常束手无策。尽管有些靶向药物可以用来治疗晚期癌症,但抛开价格昂贵不说,其疗效也很有限。因此如果能够做到及早诊断,将会大大增加癌症患者的收益。然而,目前临床指南只推荐了肺癌、乳腺癌、结直肠癌、宫颈癌等少数癌症的人群普筛方法。随着测序技术的发展,好多新型的方法被应用在多种癌症早筛(multi-cancerearlydetection,MCED)中,比如检测血液中的循环肿瘤细胞(circulatingtumorcells)或者游离的循环肿瘤DNA(tumorcell-freeDNA,cfDNA)。早筛正是检测与正常背景基因组不同的癌症基因组特征。那么癌症早筛检测表现如何呢?

年2月3日,英国伦敦大学学院AllanHackshaw在CancerCell上发表了评论文章Newgenomictechnologiesformulti-cancerearlydetection:Rethinkingthescopeofcancerscreening,分析了部分早筛检测产品的相关数据,并提出了一些新的思考。

研究人员总结了年7月之前在pubmed以及会议摘要中出现的几款不同的癌症早筛产品相关数据。

CancerSEEK(公司:ExactScience)检测血液cfDNA中16个基因的突变和9个蛋白标记物。在初期招募了名受试者后,又招募了名女性进行CancerSEEK筛查,并且筛查阳性受试者会进一步接受有针对性的PET-CT检测以确定相关癌症位置。

Galleri(公司:GRAIL)检测是基于焦磷酸盐测序的靶向甲基化检测,涵盖超过10万个不同区域的多万个CpG位点,目前该产品有多项临床研究正在进行中,包括一项15,参与者的前瞻性研究和三项其他类型的(一项99,女性参与的乳腺癌项目、一项13,吸烟者参与的肺癌项目、一项6,参与者且根据检测结果进行相关管理)。

PanSeer(公司:SingleraGenomics)检测与Galleri类似,也是检测甲基化,但位点少,经检测个基因区域的11,CpG位点。该项研究主要采集血样样本。

Adela公司检测的为cfDNA全基因组范围内的甲基化位点;国内燃石公司依赖ELSA-seq,目前发起了两项前瞻性研究,一项超过14人,一项约为12人。

PanTum(公司:RMDMDiagnostics/ZyagnumAG)检测单核细胞上的两个标记物Apo10和TKTL1。

一款有效的肿瘤早筛产品应该同时具有这三点:高灵敏度、低假阳性率、涵盖肿瘤类型多。

根据表格中所呈现的数据,可以看到这些早筛产品的灵敏度差异比较大。当检测肿瘤不超过6种时,灵敏度超过80%;当检测肿瘤超过6种时,灵敏度只有27~62%。而灵敏度也跟肿瘤的分期有关,对于晚期来说,血液中的肿瘤标志物会比早期更多。假阳性率根据采用技术的不同在0~10%之间。

标准筛查所涵盖的肿瘤范围很小,其死亡数也仅占因癌致死的25~30%,对于剩余的70~75%的癌症患者并没有有效的标准筛查,这也是癌症早筛的目的之一即涵盖标准筛查以外的患者。另外,癌症早筛的灵敏度要低于目前的标准筛查,但假阳性率要低于标准筛查,这也是促使人们考虑将两者结合起来的因素。另外,癌症早筛可以确定癌症原发灶的位置,但这也与癌症类型有关。

癌症筛查一个危害是过度诊断,上述某个产品曾经在癌症确诊4年前就检测出了癌症的存在,但在这段时间内是否存在过度诊断的问题,则需要长时间大范围的随访来确定。另外,在理想的情况下,使用血液中的cfDNA来做癌症筛查最好,但是对于恶性的肿瘤则需要组织样本进一步确定。

最后,虽然癌症早筛是一个很新的概念,但是相关概念已经在其它疾病中已经有了很成熟的应用,比如利用母亲血液里的游离DNA进行胎儿三体筛查、染色体遗传病筛查等。利用血液进行筛查具有其独特的优越性,其相关筛查将会在未来减少癌症发病率以及死亡率方面做出巨大贡献。

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